O envolvimento da Fairey na produção de mísseis foi mantido separado da Fairey Aviation Co. e sua subsequente aquisição pelo Westland Group em 1960. A produção foi, portanto, investida na Fairey Engineering Ltd., mas em 1962 esta foi transformada em uma joint venture 50/50 com a British Aircraft Corporation (Holdings) Ltd., conhecida como BAC (AT) LTD., com escritórios em 100 Pall Mall, Londres SW1, e um capital social de £ 100. Esta empresa era independente da divisão de Armas Guiadas da BAC.
A empresa Fairey também esteve envolvida no desenvolvimento inicial de aeronaves sem piloto, o que levou ao desenvolvimento de aeronaves alvo controladas por rádio na Grã-Bretanha e nos Estados Unidos na década de 1930. Em 1931, o alvo controlado por rádio Fairey "Queen" foi desenvolvido, com um lote de três exemplares sendo fabricados. O Queen era um barco voador Fairey IIIF modificado (uma aeronave lançada por catapulta usada para reconhecimento pela Marinha Real Britânica). Além da instalação de equipamentos de rádio, o Queen também teve algumas modificações aerodinâmicas para melhorar a estabilidade. No entanto, os primeiros voos sem piloto terminaram rapidamente, pois os drones caíram na decolagem da catapulta do HMS Valiant.
Em 1960, Fairey anunciou um acordo entre Fairey Engineering Ltd e Del Mar Engineering Laboratories, Los Angeles, Califórnia, para distribuir uma gama de sistemas de alvos rebocados subsônicos e supersônicos (RADOP) para treinamento de armas guiadas ar-ar e superfície-ar na Europa, África, Oriente Médio, Commonwealth e Reino Unido.
A controladora Fairey e sua subsidiária australiana estiveram ativamente envolvidas no desenvolvimento de armas guiadas. A Divisão de Armamento da Fairey Engineering Ltd. foi responsável no Reino Unido pelo alvo não tripulado *Jindivik Mk 2B").
O "Fairey V.T.O." Era uma aeronave de asa delta de decolagem vertical projetada para explorar a possibilidade de construção de uma aeronave que decolasse em rampas curtas e com baixa aceleração. Apresentado pela primeira vez na exposição da Society of British Aircraft Constructors (SBAC) em 1952, o projeto Fairey VTO foi usado para testar a configuração básica de futuras aeronaves de pesquisa. Cada asa tinha um grande aileron e a empenagem vertical abrigava um grande leme. O VTO obteve 4,0 kN de empuxo de cada bico Beta e, para o lançamento, foram utilizados dois propulsores de combustível sólido de 2,7 kN cada, elevando o empuxo total para 13 kN, obviamente superior ao peso total. O foguete Beta I tinha dois propulsores, um dos quais podia girar lateralmente e outro verticalmente, de acordo com sinais de um piloto automático. Desta forma, a linha de empuxo média resultante poderia ser variada para manter o vôo controlado em baixas velocidades. Fairey conduziu vários testes bem-sucedidos, o primeiro dos quais foi realizado em um navio na Baía de Cardigan em 1949.
Fairey Rocket Test Vehicle 1, anteriormente conhecido como LOPGAP (Oxigênio Líquido e Projétil Antiaéreo Guiado por Gasolina). O projeto original remonta à especificação da Marinha Real de 1944 para um míssil antiaéreo guiado conhecido como LOPGAP. Em 1947, o Royal Aircraft establishment assumiu o desenvolvimento e o míssil foi renomeado para RTV1. Várias versões do RTV1 básico foram desenvolvidas.
A Fairey Aviation Company da Australasia Pty Ltd recebeu um contrato para construir 40 foguetes RTV1e. Os primeiros foram concluídos no início de 1954. Os componentes foram construídos pelo Royal Australian Navy Torpedo establishment (unidades servo-hidráulicas), EMI (receptores e amplificadores de orientação) e pela Commonwealth Aircraft Corporation (fundições de magnésio). Algumas peças também foram importadas do Reino Unido. A montagem foi realizada em Salisbury, Sul da Austrália, pela Divisão de Projetos Especiais da Fairey. Os testes de disparo ocorreram entre 1955 e 1956, mas a essa altura o RTV1 era considerado obsoleto. O RTV1e foi o veículo de teste de orientação de feixe. A orientação do radar foi fornecida por uma unidade de radar que projetou um feixe estreito. Foram criadas diferentes versões do veículo de teste, cada uma lidando com um aspecto diferente do controle, orientação, propulsão e aerodinâmica de todo o foguete. O RTV 1e era um foguete de combustível líquido de dois estágios usado para pesquisa e desenvolvimento de problemas associados a mísseis guiados por feixe. Foi disparado em um ângulo de 35 graus e atingiu uma altitude máxima de cerca de 3.650 m. O veículo foi lançado por sete foguetes propulsores sólidos com duração de queima de quatro segundos, após os quais o motor de sustentação de combustível líquido assumiu o controle.
No Farnborough Air Show de 1954, a Fairey Australia exibiu um enorme míssil semelhante ao RTV1. A base consistia em uma unidade de aceleração de aproximadamente 6 pés de altura e 20 polegadas de diâmetro, estabilizada por quatro aletas grandes e quatro pequenas, e abrigando sete motores de cinco polegadas. O corpo principal tinha aproximadamente 17 pés de comprimento e um diâmetro de 10 polegadas. A carroceria estava equipada com quatro asas e quatro pequenas palhetas de controle.
A Fairey Australia também exibiu um veículo de teste aerodinâmico, descrito como um "projétil alado de três polegadas". Este era um projétil simples e não guiado para facilitar as investigações sobre as propriedades de vários conjuntos de asas e corpos em altas velocidades supersônicas. O espécime mostrado tinha cerca de 15 centímetros de comprimento e um corpo finamente acabado, pintado de branco, aparentemente feito de um tubo sem costura. A cerca de dois terços da distância do nariz, foi instalada uma asa de madeira laminada com cerca de 60 cm de envergadura, colocada transversalmente ao diâmetro do corpo, com corda fundamental de cerca de 45 cm e curvatura de quarto de corda de cerca de 50 graus.
Em abril de 1947, Fairey publicou detalhes de seu primeiro míssil guiado. Foi uma arma antiaérea projetada para a Guerra do Pacífico (1937-1945), mas não foi concluída a tempo para uso pelo Exército Britânico (que originalmente a encomendou) ou pela Marinha Real Britânica. O Ministério do Abastecimento solicitou o encerramento do projeto e o resultado foi o Pateta. Tinha comprimento de 2,27 m, envergadura de 2,08 m, diâmetro de corpo de 17 polegadas e peso de 335 kg, com ogiva. A propulsão consistia em quatro foguetes principais de combustível sólido com empuxo de 330 N, mas inicialmente quatro foguetes de reforço adicionais com empuxo de 5.600 libras aceleraram o Stooge de sua rampa. Ao contrário dos projetos posteriores, o Stooge foi projetado para altas velocidades subsônicas e alcances limitados. O Stooge precisava de uma rampa de lançamento e transporte.
O míssil Malkara foi projetado na Austrália por empresas britânicas e australianas. Era um míssil pesado guiado por fio, lançado a partir de veículos, embarcações leves e locais fixos. Esta arma substituiu o projeto Fairey "Orange William" do Ministério da Defesa, que mais tarde daria origem ao Swingfire. A Fairey Engineering era a agência de vendas para todos os países fora dos Estados Unidos e também foi nomeada pelo Departamento de Abastecimento Australiano para auxiliar na introdução do Malkara em serviço operacional e no projeto e produção de modificações. O míssil estava em serviço no Royal Armored Corps, implantado em um veículo especial, o Humber Hornet, fabricado pela Wharton Engineering, que carregava dois projéteis em lançadores e dois projéteis guardados. O Hornet podia ser lançado do ar e tinha uma tripulação de três pessoas. Para fins de treinamento foi utilizado o Malkara Mk I, com alcance de cerca de 2.000 m. A arma operacional era o Malkara Mk 1 A, que tinha um tipo diferente de sinalizador de rastreamento, um fio-guia mais fino e outras melhorias para fornecer aproximadamente o dobro do alcance do Mk 1.
O Fairey Fireflash foi uma das primeiras armas ar-ar guiadas por radar. Desenvolvido como "Blue Sky", uma versão reduzida do míssil Red Hawk, ele entrou em serviço por um breve período antes de ser substituído pelo de Havilland Firestreak.
O Green Cheese era um míssil nuclear tático anti-navio do Gannet. Problemas com o Gannet levaram ao desenvolvimento contínuo do Blackburn Buccaneer, mas foi cancelado.