Em geral

podridão parda é causada por certos fungos saprotróficos pertencentes à divisão Basidiomycota. Este tipo de podridão caracteriza-se, ao contrário da podridão branca), por ser realizada pela secreção de peróxido de hidrogênio pelas hifas. Este peróxido de hidrogênio, por meio de um processo conhecido como reação de Fenton, libera radicais livres "Radicais (química)") que são responsáveis ​​pela degradação da lignina por meio de uma reação em cadeia que destruirá o polímero de lignina.[1]​.

Essa podridão se concentra mais na degradação de compostos da parede celular vegetal, como celulose e hemicelulose. Embora a lignina seja parcialmente modificada, ela não é completamente degradada. É por isso que podemos reconhecer a podridão parda na natureza pela formação de padrões cúbicos em um tronco em decomposição.[2]​.

A podridão parda é considerada uma novidade evolutiva porque a "podridão branca" implica que existem várias cópias de genes que codificam enzimas peroxidases de classe II, porém, na podridão parda esse número de cópias genéticas é extremamente reduzido; isso implica que não haverá gasto de energia pela célula para sintetizar enzimas peroxidase, o peróxido de hidrogênio será simplesmente liberado no meio ambiente.[2]​.

Esta novidade evolutiva se repete em cinco grupos de fungos: Boletales, Polyporales, Dacrymycetes, Gloeophyllales e Lyophyllaceae. Isto pode ser interpretado de tal forma que a podridão parda forma um grupo polifilético de fungos.[3]​.

Embora a podridão parda seja quase exclusiva dos fungos sapróbicos, ela também existe dentro dos fungos que formam ectomicorrizas: no grupo Boletales. Este fenômeno está associado porque os fungos ectomicorrízicos, por viverem nas raízes das plantas e estabelecerem uma relação simbiótica mutualística "Mutualismo (biologia)"), não necessitam do poder degradativo que os fungos que vivem em partes mais duras da árvore, como o tronco, necessitam; Por viverem nas raízes "Raiz (botânica)") realizam a penetração intracelular sem que haja degradação da parede celular.[1]​.

A podridão parda é exclusiva de madeiras macias, como as coníferas. Esse aspecto é relevante porque os integrantes da Pinales produzem resinas que possuem atividade antimicrobiana: essas resinas evitam a colonização de microrganismos em diferentes partes da planta; É um sistema de defesa. Levando isso em consideração, os fungos que realizam a podridão parda são capazes de resistir a essas resinas através da produção de metabólitos secundários, estes serão secretados extracelularmente como camada protetora para o micélio.[2]​.

Por outro lado, os fungos da podridão branca") são adaptados para crescer em madeiras nobres; este tipo de madeira é encontrado em plantas pertencentes ao grupo das Angiospermas.[2]​.